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| Data de publicação | Data de defesa | Título | Autor(es) | Orientador(es) | Coorientador(es) |
| Jun-2004 | - | Activity patterns of nine phyllostomid bat species in a fragment of the Atlantic Forest in southeastern Brazil | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza; Marinho Filho, Jader | - | - |
| 28-Mai-2011 | 25-Mai-2009 | Análise morfométrica, morfológica e citogenética de morcegos do gênero Artibeus Leach, 1821 (Chiroptera, Phyllostomidae) | Fialho, Flávia Sibele Foltran | Grisolia, Cesar Koppe | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza |
| 22-Ago-2019 | 28-Fev-2019 | Análises da diversidade e estrutura genética de populações de Carollia perspicillata (Chiroptera, Phyllostomidae) em Unidades de Conservação do Cerrado | Cardoso, Tais de Menezes | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | Rodrigues, Fernando Pacheco |
| 15-Set-2009 | 2008 | Assembléias de morcegos (Mammalia: Chiroptera) em áreas preservadas e degradadas do Cerrado do Distrito Federal | Oliveira, Hernani Fernandes Magalhães de | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | - |
| 29-Jul-2013 | 5-Mar-2013 | Avaliação da percepção de cores do morcego frugívoro Artibeus lituratus (Olfers, 1818) (Chiroptera: Phyllostomidae) | Gutierrez, Eduardo de Almeida | Pessoa, Valdir Filgueiras | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza |
| 2000 | - | Bats from Fazenda Intervales, Southeastern Brazil: species account and comparison between different sampling methods | Portfors, Christine V.; Fenton, M. Brock; Aguiar, Ludmilla Moura de Souza; Baumgarten, Julio E.; Vonhof, Maarten J.; Bouchard, Sylvie; Faria, Deborah M. de; Pedro, Wagner A.; Rauntenbach, Naas I. L.; Zortea, Marlon | - | - |
| Mar-2011 | - | Descriptive ecology of bat flies (Diptera: Hippoboscoidea) associated with vampire bats (Chiroptera: Phyllostomidae) in the cerrado of central Brazil | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza; Antonini, Yasmine | - | - |
| 22-Out-2010 | 2005 | Ecologia e conservação da quiropterofauna no corredor Cerrado-Pantanal | Coelho, Daniela Cunha | Diniz Filho, José Alexandre Felizola | - |
| 19-Ago-2016 | 29-Abr-2016 | Ensino de ecologia : uma proposta dialógica sobre conservação de morcegos com estudantes de ensino fundamental | Lima, Júlia Machado de | Avanzi, Maria Rita | - |
| Abr-2012 | - | Falco sparverius (Aves: Falconiformes) preying upon Nyctinomops laticaudatus (Chiroptera: Molossidae) | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza; Motta, Adarene; Esberárd, Carlos | - | - |
| 2013 | - | Flagging a species as threatened : the case of Eptesicus taddeii, an endemic bat from the Brazilian Atlantic Forest | Bernard, Enrico; Nascimento, Jorge Luiz do; Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | - | - |
| 24-Nov-2021 | 26-Ago-2021 | Forma, função e evolução da folha nasal em Phyllostomidae (Mammalia, Chiroptera) | Machado, Luisa de Souza Aguiar | Klaczko, Julia | - |
| 4-Jul-2012 | 5-Mar-2012 | Interação morcego-fruto : estado da arte no Brasil e um estudo da chuva de sementes por aves e morcegos em uma área do Cerrado em Brasília | Sette, Isadora de Miranda e Souza | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | - |
| 2015 | - | Mammal richness and diversity in Serra do Facão region, Southeastern Goiás state, central Brazil | Gomes, Leonardo de Paula; Rocha, Clarisse Rezende; Brandão, Reuber Albuquerque; Marinho-Filho, Jader | - | - |
| 13-Abr-2011 | 14-Mai-2010 | Morcegos cavernícolas e relações parasita-hospedeiro com moscas estreblídeas em cinco cavernas do Distrito Federal | Portella, Alexandre de Souza | Marinho Filho, Jader Soares | - |
| 14-Set-2012 | 2-Mai-2012 | Morcegos do Amapá e a resposta da família Phyllostomidae à variáveis de composição de paisagens pouco fragmentadas na Amazônia | Martins, Ana Carolina Moreira | Marinho Filho, Jader Soares | - |
| 28-Fev-2020 | 11-Jun-2019 | Morcegos na beira da estrada : atividade, diversidade, forrageio e atropelamentos | Ramalho, Daniel de Figueiredo | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | - |
| 29-Nov-2015 | 31-Jul-2015 | Padrões biogeográficos da quiropterofauna brasileira | Rosa, Renato Oliveira Lopes da | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | - |
| 4-Jan-2016 | 30-Jul-2015 | Plasticidade no comportamento acústico de Molossops temminckii (Chiroptera: Molossidae) | Oliveira, Thiago Furtado de | Aguiar, Ludmilla Moura de Souza | - |
| Nov-2006 | - | Seasonal variation and food deprivation in common vampire bats (Chiroptera: phyllostomidae) | Freitas, Mariella Bontempo Duca de; Welker, Alexis Fonseca; Pinheiro, Eliana de Cássia | - | - |
