| Campo DC | Valor | Idioma |
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| dc.contributor.advisor | Rossato, Maurício | - |
| dc.contributor.author | Ferreira, Luciellen da Costa | - |
| dc.date.accessioned | 2022-02-15T15:34:44Z | - |
| dc.date.available | 2022-02-15T15:34:44Z | - |
| dc.date.issued | 2022-02-15 | - |
| dc.date.submitted | 2021-10-11 | - |
| dc.identifier.citation | FERREIRA, Luciellen da Costa. Diversidade de Xanthomonas euvesicatoria pv. allii, agente causal da queima bacteriana em cebola no cerrado brasileiro. 2021. 85 f., il. Dissertação (Mestrado em Fitopatologia) — Universidade de Brasília, Brasília, 2021. | pt_BR |
| dc.identifier.uri | https://repositorio.unb.br/handle/10482/42910 | - |
| dc.description | Dissertação (mestrado) — Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2021. | pt_BR |
| dc.description.abstract | A cebola (Allium cepa L.) é uma hortaliça pertencente à família Amaryllidaceae, cujo cultivo é
disseminado mundialmente. No Brasil é a terceira hortaliça mais produzida, após o tomate e
batata. Um surto de queima bacteriana em campos de cebola nos estados de Minas Gerais,
Goiás e Distrito Federal, todos em áreas do bioma Cerrado, ocorreu entre os anos 2018 e 2019,
e bactérias do gênero Xanthomonas foram isoladas das amostras coletadas. O objetivo desse
estudo foi identificar e caracterizar os isolados oriundos de plantas de cebola, e das invasoras
leiteira, caruru e da cultura da soja presentes em campos previamente cultivados com cebola.
Os métodos usados foram: PCR-específica, análise da diversidade em uma coleção de 36
isolados por BOX-PCR e Multilocus sequence analysis (MLSA) de quatro genes housekeeping:
dnaK, fyuA, gyrB e rpoD, sequenciamento genômico completo de isolados representativos da
coleção e detecção de genes associados a resistência ao cobre. A análise por BOX-PCR dos
isolados de Xanthomonas provenientes de campos de cebola, evidenciou elevada diversidade,
com oito haplótipos identificados, correlacionados com cultivares específicas de cebola, sendo
especulado que cada isolado/ haplótipo pode ter tido sua introdução associada às sementes
dessas cultivares. O MLSA revelou que os isolados pertencem à espécie Xanthomonas
euvesicatoria e foram filogeneticamente próximos a bactérias originalmente de Allium spp. de
diversas regiões do mundo. Na árvore filogenética os isolados foram separados em quatro
diferentes clados, indicando novamente uma alta diversidade na coleção. O sequenciamento
genômico de cinco isolados representativos da diversidade haplotípica da coleção revelou
ausência de plasmídeos, e dados gerais similares aos previamente descritos para o gênero.
Nenhum dos isolados apresentou genes relacionados à resistência ao cobre (cop) sendo uma
possibilidade o controle do patógeno com esse produto químico. A análise de efetores revelou
um conjunto de mais de 27 efetores do sistema de secreção tipo III (T3SS) presentes nos
isolados sequenciados, podendo explicar a capacidade de infectar a cebola e demais
hospedeiras | pt_BR |
| dc.description.sponsorship | Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq). | pt_BR |
| dc.language.iso | Português | pt_BR |
| dc.rights | Acesso Aberto | pt_BR |
| dc.title | Diversidade de Xanthomonas euvesicatoria pv. allii, agente causal da queima bacteriana em cebola no cerrado brasileiro | pt_BR |
| dc.type | Dissertação | pt_BR |
| dc.subject.keyword | Allium cepa | pt_BR |
| dc.subject.keyword | BOX-PCR | pt_BR |
| dc.subject.keyword | Cebola - doenças e pragas | pt_BR |
| dc.subject.keyword | Sequenciamento genômico | pt_BR |
| dc.rights.license | A concessão da licença deste item refere-se ao termo de autorização impresso assinado pelo autor com as seguintes condições: Na qualidade de titular dos direitos de autor da publicação, autorizo a Universidade de Brasília e o IBICT a disponibilizar por meio dos sites www.bce.unb.br, www.ibict.br, http://hercules.vtls.com/cgi-bin/ndltd/chameleon?lng=pt&skin=ndltd sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei nº 9610/98, o texto integral da obra disponibilizada, conforme permissões assinaladas, para fins de leitura, impressão e/ou download, a título de divulgação da produção científica brasileira, a partir desta data. | pt_BR |
| dc.description.abstract1 | Onion (Allium cepa L.) is a vegetable from the Amaryllidaceae family, being produced all over the
world, this crop is the third most produced vegetable in Brazil. A recent outbreak of bacterial blight
in onion fields from central Brazil, specifically on the Cerrado biome, during the years of 2018 and
2019 was identified and bacterial isolates were acquired. The goal of this study was to identify
and characterize 36 bacterial isolates from plants of onion, soy, Euphorbia heterophylla and
Amaranthus sp. from onion fields. Onion isolates were characterized by using PCR with primers
XgumF7/R7, BOX-PCR, multilocus sequence analysis with four housekeeping genes, dnaK,
fyuA, gyrB and rpoD and whole genomic sequencing. Lastly, isolates were evaluated for the
presence of copper-resistance genes. BOX-PCR resulted in a high diversity profile among
isolates with eight haplotypes detected. Each strain presented a correlation with onion cultivars,
highlighting the hypothesis of the introduction of each strain by specific cultivars. MLSA revealed
that all isolates are Xanthomonas euvesicatoria and are phylogenetically close to bacterial
isolates from Allium spp. from different world regions. The onion isolates clustered among four
different clades in the phylogenetic tree, confirming the high genetic diversity showed previously
on the BOX-PCR. The genomic sequencing of five representative isolates revealed the absence
of plasmids and other data similar to other Xanthomonas genomic sequences. None of the
isolates have copper-resistance related genes, being a possibility the control of this disease with
copper-based fungicides. The type three secretion system effectors study showed a set of more
than 27 effectors present on all sequenced isolates, with the probable reason for the host range
within this variant. | pt_BR |
| dc.description.unidade | Instituto de Ciências Biológicas (IB) | pt_BR |
| dc.description.unidade | Departamento de Fitopatologia (IB FIT) | pt_BR |
| dc.description.ppg | Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia | pt_BR |
| Aparece nas coleções: | Teses, dissertações e produtos pós-doutorado
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