Diversidade bacteriana de olhos de cães com úlcera corneana : uma análise metagenômica

Abstract

Objetivo: Descrever o microbioma bacteriano da superfície ocular de cães com olhos saudáveis e com ceratite ulcerativa através de análise do gene rRNA 16S. Materiais e Métodos: Os animais foram divididos em grupo 1 (G1),constituído por 12 cães com olhos saudáveis e sem doenças oculares pré-existentes; e grupo 2 (G2), composto por 08 indivíduos com úlcera corneana. Foram coletados swabs da superfície ocular para isolamento bacteriano,avaliação morfotintorial e para extração de DNA total. A região V4 do gene rRNA 16S foi amplificada por PCR e submetida asequenciamento de alto desempenho. Resultados: A análise do rRNA 16S identificou maior quantidade de microrganismos do que a cultura bacteriana. Emolhos saudáveis verificou-sepredominância de Pseudomonas(51,98%), Staphylococcus(10,08%) e Acinetobacter (9,84%), e nos olhos ulcerados Pseudomonas (44,21%), Acinetobacter (11,77%) e Bacillus (8,92%).Quinhentos e cinquenta e sete ASVs foram identificados, dentre eles 237 no G1, 108 no G2e 212 foram encontrados em ambos os grupos.Houve uma maior diversidade bacteriana em G1, embora sem diferença estatística entre os grupos.Conclusão: Descreveu-se, de forma inédita, o microbioma de cães com ceratite ulcerativa comparativamente ao microbioma da superfície ocular hígida. Constatou-se, ainda maior quantidade de espécies bacterianas através de método metagenômico comparativamente aos métodos dependentes de cultura. Salienta-se a falta de homogeneidade das bactérias encontradas nos olhos ulcerados, dificultando a escolha de uma terapêutica empírica.