Campo DC | Valor | Idioma |
dc.contributor.advisor | Campos, Tatiana Amabile de | - |
dc.contributor.author | Sudbrack, Leticia Olivier | - |
dc.date.accessioned | 2024-10-29T16:29:55Z | - |
dc.date.available | 2024-10-29T16:29:55Z | - |
dc.date.issued | 2024-10-29 | - |
dc.date.submitted | 2023-12-15 | - |
dc.identifier.citation | SUDBRACK, Leticia Olivier. Caracterização de Serratia marcescens pan-resistentes causadoras de bacteremia por abordagens fenotípicas, genéticas e genômicas. 2023. 70 f., il. Dissertação (Mestrado em Biologia Microbiana) — Universidade de Brasília, Brasília, 2023. | pt_BR |
dc.identifier.uri | http://repositorio.unb.br/handle/10482/50753 | - |
dc.description | Dissertação (mestrado) — Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, Pós-Graduação em Biologia Microbiana, 2023. | pt_BR |
dc.description.abstract | A resistência antimicrobiana (RAM) acontece quando bactérias não respondem às
quimioterapias ofertadas tornando as infecções mais difíceis de serem tratadas
podendo levar à morte do paciente. Serratia marcescens é uma enterobactéria
responsável por causar infecções relacionadas à assistência à saúde (IRAS) e,
frequentemente, apresentam RAM. Esta espécie é considerada um agente causador de
infecções oportunistas de tratamentos desafiadores devido à presença de vários tipos
de mecanismos promotores de RAM. Neste contexto, é fundamental que se amplie o
estudo dos mecanismos de disseminação de RAM visando o diagnóstico rápido e
preciso, além do rastreamento epidemiológico para interromper a cadeia de
transmissão de RAM dentro do ambiente. No presente trabalho, quatro (4) isolados de
Serratia marcescens causadores de bacteremia em pacientes internos em uma Unidade
de Terapia Intensiva (UTI) foram submetidos à determinação do perfil de
susceptibilidade antimicrobiana e de epidemiologia molecular. A determinação do perfil
de susceptibilidade antimicrobiana foi determinada por testes fenotípicos
(antibiograma por métodos automatizados, disco difusão e imunocromatografia),
genotípico para a detecção de beta-lactamases (PCR) e por genômica (sequenciamento
WGS). O delineamento da cadeia de transmissão dos isolados foi determinado por
epidemiologia molecular através da análise de fingerprinting de sequencias repetitivas
intergênicas para enterobactérias (ERIC-PCR) e por pangenoma. As análises fenotípicas
e de genômica para não susceptibilidade demonstram que todos os isolados se
apresentaram resistentes a todos antimicrobianos disponíveis sendo classificados como
pan-resistentes (PDR). A imunocromatografia identificou as carbapenemases KPC e
NDM em todos os isolados, contudo a genotipagem por PCR identificou KPC apenas em
2 isolados e a genômica não identificou a enzima em nenhum deles. As análises de
similaridade genética por ERIC-PCR e pangenomica determinou que os isolados se
apresentaram filogeneticamente idênticos e, portanto, clonais. Em sua totalidade os
resultados indicam que análises genômicas por WGS são ferramentas precisas e
robustas para o diagnóstico de RAM, contudo a mesma deve ser realizada
imediatamente após o isolamento bacteriano para evitar diagnósticos imprecisos
devido à instabilidade dos genes associados aos plasmídeos em que os genes estão inseridos, como no caso de blaKPC que codifica a enzima KPC. A análise de pan-genoma,
também, demonstrou-se precisa para a identificação de clones bacterianos entre os
isolados, além de possibilitar identificar a presença de clones de disseminação mundial. | pt_BR |
dc.language.iso | por | pt_BR |
dc.rights | Acesso Aberto | pt_BR |
dc.title | Caracterização de Serratia marcescens pan-resistentes causadoras de bacteremia por abordagens fenotípicas, genéticas e genômicas | pt_BR |
dc.type | Dissertação | pt_BR |
dc.subject.keyword | Resistência antimicrobiana | pt_BR |
dc.subject.keyword | Epidemiologia | pt_BR |
dc.subject.keyword | Enterobactérias | pt_BR |
dc.rights.license | A concessão da licença deste item refere-se ao termo de autorização impresso assinado pelo autor com as seguintes condições: Na qualidade de titular dos direitos de autor da publicação, autorizo a Universidade de Brasília e o IBICT a disponibilizar por meio dos sites www.unb.br, www.ibict.br, www.ndltd.org sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei nº 9610/98, o texto integral da obra supracitada, conforme permissões assinaladas, para fins de leitura, impressão e/ou download, a título de divulgação da produção científica brasileira, a partir desta data. | pt_BR |
dc.description.abstract1 | Antimicrobial resistance (AMR) occurs when bacteria do not respond to offered
therapies, making infections more difficult to treat and potentially leading to the
patient's death. Serratia marcescens is an enterobacteria responsible for causing
healthcare-associated infections (HAIs) and frequently present AMR. This species is
considered a causative agent of treatment-challenging opportunistic infections due to
the presence of several types of AMR-promoting mechanisms. In this context, it is
essential to expand the study of AMR dissemination mechanisms with a view to rapid
and accurate diagnosis, in addition to epidemiological tracking to interrupt the chain of
AMR transmission within the environment. In the present work, four (4) isolates of
Serratia marcescens causing bacteremia in patients admitted to an Intensive Care Unit
(ICU) were subjected to determination of the antimicrobial susceptibility profile and
molecular epidemiology. The determination of the antimicrobial susceptibility profile
was determined by phenotypic tests (antibiogram using automated methods, disk
diffusion and immunochromatography), genotypic tests for the detection of betalactamases (PCR) and genomic tests (WGS sequencing). The delineation of the
transmission chain of the isolates was determined by molecular epidemiology through
fingerprinting analysis of intergenic repetitive sequences for enterobacteria (ERIC-PCR)
and by pangenome. Phenotypic and genomic analyzes for non-susceptibility
demonstrated that all isolates were resistant to all available antimicrobials and were
classified as pan-resistant (PDR). Immunochromatography identified the
carbapenemases KPC and NDM in all isolates, however PCR genotyping identified KPC in
only 2 isolates and genomics did not identify the enzyme in any of them. Genetic
similarity analysis by ERIC-PCR and pangenomics determined that the isolates were
phylogenetically identical and, therefore, clonal. In total, the results indicate that
genomic analyzes by WGS are accurate and robust tools for diagnosing AMR, however it
must be performed immediately after bacterial isolation to avoid inaccurate diagnoses
due to loss of unstable genetic elements, as in the case of blaKPC which encodes the KPC
enzyme. Pan-genome analysis also proved to be accurate for identifying bacterial clones
among isolates, in addition to making it possible to identify the presence of clones that
spread worldwide. | pt_BR |
dc.description.unidade | Instituto de Ciências Biológicas (IB) | pt_BR |
dc.description.unidade | Departamento de Biologia Celular (IB CEL) | pt_BR |
dc.description.ppg | Programa de Pós-Graduação em Biologia Microbiana | pt_BR |
Aparece nas coleções: | Teses, dissertações e produtos pós-doutorado
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