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Title: Genetic characterization of coat color genes in Brazilian Crioula sheep from a conservation nucleus
Other Titles: Caracterização genética de genes para cor da pelagem do núcleo de conservação da ovelha Crioula no Brasil
Authors: Cavalcanti, Lilian Cristina Gomes
Moraes, José Carlos Ferrugem
Faria, Danielle Assis de
Pimentel, Concepta Margaret McManus
Nepomuceno, Alcebiades Renato
Souza, Carlos José Hoff de
Caetano, Alexandre Rodrigues
Paiva, Samuel Rezende
Assunto:: Recursos genéticos - conservação
Marcadores genéticos
Issue Date: Aug-2017
Publisher: Embrapa Informação Tecnológica - Pesquisa Agropecuária Brasileira
Citation: CAVALCANTI, Lilian Cristina Gomes et al. Genetic characterization of coat color genes in Brazilian Crioula sheep from a conservation nucleus. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 52, n. 8, p. 615-622, ago. 2017. Disponível em: <http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2017000800615&lng=en&nrm=iso>. Acesso em: 22 fev. 2018. doi: http://dx.doi.org/10.1590/s0100-204x2017000800007.
Abstract: O objetivo deste trabalho foi identificar polimorfismo de nucleotídeo único (SNPs) em dados de ressequenciamento dos genes MC1R, ASIP e TYRP1, obtidos de ovelhas Crioulas (Ovis aries) com cores de pelagem distintas. Polimorfismos nos genes ASIP (agouti-signaling protein), MC1R (melanocortin 1 receptor) e TYRP1 (tyrosinase-related protein 1) foram analisados em 115 ovinos, provenientes do núcleo de conservação da ovelha Crioula, da Embrapa. No total, 7.914 pb foram sequenciados por animal, e 14 SNPs foram identificados. Dois ensaios adicionais foram realizados para detectar duplicações e deleções no gene ASIP. Noventa e cinco por cento da variação de cor da pelagem foi explicada pelas interações epistáticas entre alelos específicos dos genes MC1R e ASIP. Evidências sugerem um importante papel das variantes TYRP1 para cor da lã, apesar das suas baixas frequências. O painel de marcadores usado foi eficiente em detectar alelos associados à coloração da pelagem nos animais estudados e, portanto, pode ser usado na implementação de um programa de seleção assistida por marcadores, no núcleo de conservação de ovinos da raça Crioula.
Abstract: The objective of this work was to identify single nucleotide polymorphisms (SNPs) in resequencing data from MC1R, ASIP, and TYRP1 genes derived from Crioula sheep (Ovis aris) with different coat colors. Polymorphisms in the ASIP (agouti-signaling protein), MC1R (melanocortin 1 receptor), and TRYP1 (tyrosinase-related protein 1) genes were analyzed in 115 sheep from Embrapa’s conservation nucleus of crioula sheep, in Brazil. A total of 7,914 bp were sequenced per animal, and 14 SNPs were identified. Two additional assays were performed to detect duplications and deletions in the ASIP gene. Ninety-five percent of the coat color variation was explained by epistatic interactions observed between specific alleles in the MC1R and ASIP genes. Evidence suggests an important role of TYRP1 variants for wool color, despite their low frequencies. The marker panel was efficient enough in predicting coat color in the studied animals and, therefore, can be used to implement a marker-assisted selection program in the conservation nucleus of sheep of the crioula breed.
metadata.dc.description.unidade: Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária (FAV)
Licença:: Pesquisa Agropecuária Brasileira - This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License (CC BY 4.0). Fonte: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2017000800615&lng=en&nrm=iso. Acesso em: 22 fev. 2018.
DOI: http://dx.doi.org/10.1590/s0100-204x2017000800007
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