http://repositorio.unb.br/handle/10482/36266| File | Size | Format | |
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| ARTIGO_ValidationCustomizedSubset.pdf | 235,39 kB | Adobe PDF | View/Open |
| Title: | Validation of a customized subset of SNPs for sheep breed assignment in Brazil |
| Other Titles: | Validação de um subconjunto de SNPs específicos para certificação racial de ovinos no Brasil |
| Authors: | Paim, Tiago do Prado Pimentel, Concepta Margaret McManus Vieira, Fábio Danilo Oliveira, Stanley Robson de Medeiros Facó, Olivardo Azevedo, Hymerson Costa Araújo, Adriana Mello de Moraes, José Carlos Ferrugem Yamagishi, Michel Eduardo Beleza Carneiro, Paulo Luiz Souza Caetano, Alexandre Rodrigues Paiva, Samuel Rezende |
| metadata.dc.identifier.orcid: | http://orcid.org/0000-0002-9486-7128 http://orcid.org/0000-0002-1106-8962 http://orcid.org/0000-0002-8686-3338 http://orcid.org/0000-0003-4879-7015 http://orcid.org/0000-0001-8313-9830 http://orcid.org/0000-0002-0187-9227 http://orcid.org/0000-0002-7458-0656 http://orcid.org/0000-0002-1230-9000 http://orcid.org/0000-0001-7109-3038 http://orcid.org/0000-0001-7708-6197 http://orcid.org/0000-0002-3419-7337 http://orcid.org/0000-0001-6687-2491 |
| Assunto:: | Ovelha Recursos genéticos - animais Certificação de origem Genômica Rastreabilidade Ovino |
| Issue Date: | 2019 |
| Publisher: | Embrapa Secretaria de Pesquisa e Desenvolvimento Pesquisa Agropecuária Brasileira |
| Citation: | PAIM, Tiago do Prado et al. Validation of a customized subset of SNPs for sheep breed assignment in Brazil. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 54, e00506, 2019. DOI: https://doi.org/10.1590/s1678-3921.pab2019.v54.00506. Disponível em: http://scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2019000104302. Acesso em: 23 jan. 2020. |
| Abstract: | O objetivo deste trabalho foi avaliar a utilidade de um subconjunto de 18 polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) para a certificação das raças de ovinos Crioula Brasileira, Morada Nova (MN) e Santa Inês (SI). Dados de 588 animais foram analisados com o programa Structure. Em 82% dos casos, observou-se designação racial correta com confiança acima de 90%. A maioria dos casos de designação incorreta de raça foi observada em MN e SI. Portanto, apesar de o subconjunto de 18 SNPs ter confiabilidade elevada, ele não é suficiente para a inequívoca certificação das raças estudadas, principalmente das deslanadas. É necessário o desenvolvimento de um painel mais preciso para uso amplo em certificação racial. |
| Abstract: | The objective of this work was to evaluate the usefulness of a subset of 18 single nucleotide polymorphisms (SNPs) for breed identification of Brazilian Crioula, Morada Nova (MN), and Santa Inês (SI) sheep. Data of 588 animals were analyzed with the Structure software. Assignments higher than 90% confidence were observed in 82% of the studied samples. Most of the low-value assignments were observed in MN and SI breeds. Therefore, although there is a high reliability in this subset of 18 SNPs, it is not enough for an unequivocal assignment of the studied breeds, mainly of hair breeds. A more precise panel still needs to be developed for the widespread use in breed assignment. |
| Licença:: | (CC BY) - This is an open-access article distributed under the Creative Commons Attribution 4.0 International License. |
| DOI: | https://doi.org/10.1590/s1678-3921.pab2019.v54.00506 |
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