Campo DC | Valor | Idioma |
dc.contributor.advisor | Resende, Renato de Oliveira | - |
dc.contributor.author | Fragoso, Karina Nascimento da Silva | - |
dc.date.accessioned | 2020-06-29T12:51:25Z | - |
dc.date.available | 2020-06-29T12:51:25Z | - |
dc.date.submitted | 2019-11-26 | - |
dc.identifier.citation | FRAGOSO, Karina Nascimento da Silva. Estudos biológicos e moleculares dos patossistemas Johnsongrass mosaic virus (JGMV) e Maize chlorotic dwarf virus (MCDV) em gramíneas forrageiras. 2019. 114 f., il. Tese (Doutorado em Biologia Molecular)—Universidade de Brasília, Brasília, 2019. | pt_BR |
dc.identifier.uri | https://repositorio.unb.br/handle/10482/38345 | - |
dc.description | Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2019. | pt_BR |
dc.description.abstract | O Brasil tem o maior rebanho bovino comercial do mundo, destinado para produção de
carne e leite, sendo majoritariamente alimentado com pastagens. A alta incidência de
pragas e doenças afeta campos com pastagens, sendo que os agentes biológicos nem
sempre são identificados. Sintomas típicos de infecções virais como mosaico,
amarelecimento generalizado e nanismo vêm sendo observados em campos
experimentais e comerciais de pastagens naturais e cultivadas. Recentemente, nosso
grupo de pesquisa identificou duas espécies virais infectando Pennisetum purpureum,
Panicum maximum e Brachiaria brizantha por meio do sequenciamento em larga escala
(High-Throughput sequencing-HTS): o Johnsongrass mosaic virus (isolado JGMVCNPGL) e o Maize chlorotic dwarf virus (isolado MCDV-BR). A partir dessa
identificação preliminar, o objetivo desse trabalho foi realizar a caracterização biológica
e molecular desses dois isolados, bem como realizar a localização subcelular das proteínas
P1, CP1, CP2 e CP3 do vírus MCDV-BR, tendo em vista que as funções destas proteínas
são pouco elucidadas. A caracterização biológica de JGMV-CNPGL e MCDV-BR é
fundamental para o desenvolvimento de estratégias de defesa contra esses agentes
etiológicos com alto poder de infecção em plantas forrageiras colocando em risco o setor
pecuário nacional, entretanto não foi realizada para o MCDV-BR, pois o vírus não passa
mecanicamente e o vetor de transmissão não foi identificado. O isolado JGMV-CNPGL,
identificado em plantas de P. purpureum, foi inoculado mecanicamente em 14 espécies
de plantas indicadoras, sendo que 10 delas foram suscetíveis. O genoma desse vírus
possui 9.865 nt, que codifica 11 proteínas (P1, HC-Pro P3, 6K1, CI, 6K2, VPg, NIa, NIb,
CP e PIPO). Os valores de identidade de nucleotídeos da capa proteica (CP) e do genoma
completo obedecem aos critérios de demarcação de espécie para o gênero Potyvirus.
Alguns motivos conservados característicos de Potyvirus foram identificados nas
proteínas codificadas por esse vírus, entretanto, o motivo KITC da HC-Pro, envolvido na
interação da partícula viral com o estilete do vetor (Afídeo), não está presente. Vale
ressaltar que a porção N-terminal da CP mostrou apenas 38% de identidade de sequência
de aminoácidos quando comparados com outros isolados de JGMV caracterizados em
outras regiões do mundo. As implicações biológicas dessa divergência de sequências
precisam ser elucidadas. O genoma de MCDV-BR, encontrado infectando Brachiaria,
possui 11.960 nt com uma ORF1 codificando uma poliproteína de 9 proteínas (P1, CP1,
CP2, CP3, R37, Hel, R69, 3C-Pro e RdRP) e uma pequena ORFx, interna e próxima da
extremidade 5ʹ da ORF1. A comparação de sequência aminoácidos das CPs (CP1, CP2 e
CP3) e RdRp (Pol) se encaixa dentro dos critérios de demarcação de espécie para gênero
Waikavirus, identificando este isolado como pertencente a espécie MCDV. A localização
subcelular de proteínas de MCDV-BR em fusão com eGFP, confirmada por colocalização com marcadores de organelas, demonstrou que a proteína P1 está presente no
citoplasma, próximo a parede celular, CP1 é endereçada a mitocôndria, CP2 forma
agregados no núcleo e CP3 está no citoplasma próximo a parede celular e também forma
agregados no núcleo. Experimentos complementares devem ser realizados para
comprovar a localização subcelular, podendo auxiliar na predição de funções das
proteínas virais. | pt_BR |
dc.description.sponsorship | CAPES | pt_BR |
dc.language.iso | Português | pt_BR |
dc.rights | Acesso Aberto | pt_BR |
dc.title | Estudos biológicos e moleculares dos patossistemas Johnsongrass mosaic virus (JGMV) e Maize chlorotic dwarf virus (MCDV) em gramíneas forrageiras | pt_BR |
dc.type | Tese | pt_BR |
dc.subject.keyword | Pastagens - manejo | pt_BR |
dc.subject.keyword | Brachiaria brizantha | pt_BR |
dc.subject.keyword | Pecuária | pt_BR |
dc.rights.license | A concessão da licença deste item refere-se ao termo de autorização impresso assinado pelo autor com as seguintes condições:Na qualidade de titular dos direitos de autor da publicação, autorizo a Universidade de Brasília e o IBICT a disponibilizar por meio dos sites www.bce.unb.br, www.ibict.br, http://hercules.vtls.com/cgi-bin/ndltd/chameleon?lng=pt&skin=ndltd sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei nº 9610/98, o texto integral da obra disponibilizada, conforme permissões assinaladas, para fins de leitura, impressão e/ou download, a título de divulgação da produção científica brasileira, a partir desta data. | pt_BR |
dc.description.abstract1 | Brazil has the largest commercial cattle herd in the world, used for beef and dairy
production, being mainly fed on pastures. The high incidence of pests and diseases affects
fields with pastures, and biological agents are not always identified. Typical symptoms
of viral infections such as mosaic, widespread yellowing and dwarfism have been
observed in experimental and commercial fields of natural and cultivated pastures. Our
research group recently identified two viral species infecting Pennisetum purpureum,
Panicum maximum and Brachiaria brizantha by High-Throughput sequencing:
Johnsongrass mosaic virus (JGMV-CNPGL isolate) and Maize chlorotic dwarf virus
(MCDV-BR isolate). From this preliminary identification, the objective of this work was
to perform the biological and molecular characterization of these two isolates, as well as
to perform the subcellular localization of proteins P1, CP1, CP2 and CP3 of the MCDVBR virus. From this preliminary identification, the objective of this work was to carry out
the biological and molecular characterization of these two isolates, as well as to perform
the subcellular localization of MCDV-BR virus proteins P1, CP1, CP2 and CP3,
considering that their functions are poorly understood. The biological characterization of
JGMV-CNPGL and MCDV-BR is fundamental for the development of defense strategies
against these etiological agents with high potential infection in forage plants putting at
risk the national livestock sector. However, characterization of MCDV-BR was not
performed, because this virus does not pass mechanically, and the transmission vector
was not identified. The JGMV-CNPGL isolate, identified in P. purpureum plants, was
mechanically inoculated in 14 host plant candidates, 10 of which were susceptible. The
genome of this virus has 9,865 nt, which encodes 11 proteins (P1, HC-Pro, P3, 6K1, CI,
6K2, VPg, NIa, NIb, CP and PIPO). The nucleotide identity values of CP and the
complete genome obey the species demarcation criteria for the genus Potyvirus. Some conserved motifs characteristic of Potyvirus have been identified in proteins encoded by
this virus, however, the HC-Pro KITC motif, involved in the interaction of the viral
particle with the vector stylets (Aphid), is not present. It is noteworthy that the N-terminal
portion of CP showed only 38% amino acid sequence identity when compared to other
JGMV isolates characterized in other regions of the world. The biological implications of
this sequence divergence need to be elucidated. The MCDV-BR virus genome, found
infecting Brachiaria, has 11,960 nt with an ORF1 encoding a polyprotein with 9 proteins
(P1, CP1, CP2, CP3, R37, Hel, R69, 3C-Pro and RdRP) and a small ORFx, internal and
near the 5ʹ end of ORF1. The peptide sequence comparison of the CPs (CP1, CP2 and
CP3) and Pol (RdRp) fits within the species demarcation criteria for Waikavirus genus,
identifying this isolate as belonging to the MCDV species. The subcellular localization
of MCDV-BR proteins fused with eGFP, confirmed by co-localization with organelle
markers, demonstrated that protein P1 is present in the cytoplasm, near the cell wall, CP1
is addressed to mitochondria, CP2 forms nucleus aggregates. and CP3 is in the cytoplasm
near the cell wall and forms aggregates in the nucleus. However, complementary
experiments should be performed to prove subcellular localization, which may aid in the
prediction of viral protein functions. | pt_BR |
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