Caracterização polifásica e análise genômica de Xanthomonas citri, agente causal da mancha bacteriana da teca (Tectona grandis)

Abstract

Teca (Tectona grandis) é uma espécie florestal nativa de florestas tropicais na Ásia que pertence a família Lamiaceae. É apreciada pela qualidade da madeira, durabilidade e resistência à pragas e doenças. Sua madeira pode ser utilizada em construções exteriores, barcos, navios e construções marinhas, esculturas e móveis. Há mais de 90.000 hectares de teca plantados no Brasil. Apesar da resistência natural, pragas e doenças podem afetar seu estabelecimento, crescimento e qualidade da madeira, como aquelas causadas por fungos, bactérias, nematoides e vírus. Nesse contexto, bactérias fitopatogênicas foram isoladas de mudas de teca de viveiro em Rosário Oeste, Mato Grosso - Brasil e Garça – São Paulo. O objetivo deste trabalho foi identificar o gênero das bactérias causadoras da mancha foliar em teca por primer específico e analisar a diversidade de 26 isolados de Xanthomonas de teca por meio do marcador BOX-PCR e identificar o agente causal por meio do sequenciamento do genoma, multilocus sequence analysis (MLSA) utilizando-se sete genes housekeeping: atpD, dnaK, efp, fyuA, glnA, gyrB e rpoD, average nucleotide identity (ANI), filogenômica com SNPs (single nucleotide polymorphism), repertório de efetores e identificação de genes de resistência ao cobre. O sequenciamento de dois genomas dos isolados de teca demonstrou não haver plasmídeos, genes TAL e regiões CRISPR. O tamanho corresponde ao esperado para o gênero Xanthomonas e conteúdo G+C: 64,6%. MLSA e ANI revelaram que os isolados de Xanthomonas de teca pertencem à espécie Xanthomonas citri e foram filogeneticamente próximas de bactérias isoladas de Phaseolus spp. A análise filogenômica também confirmou a espécie X. citri, porém os isolados foram geneticamente mais próximos de bactérias isoladas de Citrus spp. Os isolados de Xanthomonas de teca são descritos aqui como Xanthomonas citri pv. tectonae. A análise de sistemas de secreção e efetores revelou que X. citri pv. tectonae possui todos os sistemas de secreção encontrados em bactérias gram-negativas e possuem um repertório de 25 efetores. Além disso, os isolados não possuem genes de resistência ao cobre, indicando a possibilidade de utilizar compostos de cobre no controle de X. citri pv. tectonae.