Diversidade, estrutura genética e história evolutiva do Pirá-Brasília (Simpsonichthys boitonei), uma espécie de peixe anual ameaçada de extinção endêmica do Distrito Federal

Abstract

Os peixes anuais (killifishes), pertencentes à subordem Aplocheiloidei, possuem forte dimorfismo sexual e são caracterizados por estarem presentes apenas em um período do ano, durante a ocorrência de poças sazonais. A família Rivulidae, uma das maiores da ordem Cyprinodontiformes, é encontrada no continente americano e tem sofrido nos últimos anos perdas de habitat devido à atividade humana. Simpsonichthys boitonei, conhecido como Pirá-brasília, é uma espécie de rivulídeo endêmico do Distrito Federal, que se encontra presente em lagoas temporárias no período chuvoso do Cerrado. Até o momento, não havia estudos que explorassem a genética desta espécie, atualmente ameaçada e isolada em pontos específicos da região. O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética de Simpsonichthys boitonei, bem como observar sua relação filogenética e biogeográfica com outras espécies do mesmo grupo taxonômico pelo o uso de marcadores genéticos mitocondriais e nucleares. Para isso, foram utilizadas amostras de indivíduos coletados nas duas populações conhecidas, localizadas em brejos próximos aos córregos Guará e Taquara. A partir da extração de DNA das amostras foi realizado o sequenciamento e a genotipagem de locos nucleares e mitocondriais, bem como a montagem e anotação do genoma mitocondrial completo de S. boitonei. Por meio da genotipagem de locos microssatélites, foram realizadas análises de diversidade genética nas duas populações conhecidas, em que se demonstrou uma redução populacional recente e uma diferença genética significativa entre elas. A partir da montagem do genoma mitocondrial completo de S. boitonei, foi realizada uma análise filogenética utilizando mitogenomas de espécies próximas encontradas no Genbank. Trata-se do primeiro trabalho a avaliar a filogenia da ordem Cyprinodontiformes com base no genoma mitocondrial completo. Os locos sequenciados foram utilizados para a realização de análises filogenéticas, que possibilitaram apontar a posição filogenética de S. boitonei, bem como revisar a filogenia e discutir a biogeografia histórica dos grupos aos quais ela pertence.